Информация

7.7: Проверьте себя - Биология

7.7: Проверьте себя - Биология



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

7.7: Проверьте себя

Фон

Было обнаружено, что сигнатуры экспрессии генов, состоящие из десятков генов, позволяют прогнозировать тип заболевания и реакцию пациента на терапию, и они оказались информативными в бесчисленных экспериментах по изучению биологических механизмов (например, [1–4]). Таким образом, микроматрицы ДНК высокой плотности представляют собой предпочтительный метод для объективного анализа транскриптомов и представляют собой отличный путь к обнаружению сигнатур. Однако сигнатуры экспрессии генов с диагностическим потенциалом должны быть проверены на больших группах пациентов, у которых измерение всего транскриптома не является ни необходимым, ни желательным. Возможно, более важным является то, что способность описывать клеточные состояния в терминах сигнатуры экспрессии генов увеличивает возможность проведения высокопроизводительных скрининговых исследований малых молекул с использованием сигнатуры, представляющей интерес, в качестве считываемой. Однако для того, чтобы это было практичным, необходимо иметь возможность проверять тысячи соединений в день по стоимости, значительно меньшей, чем у обычных микроматриц.

Поэтому мы разработали простое, гибкое, экономичное и высокопроизводительное решение для анализа сигнатур экспрессии генов, адаптированное для измерения до 100 транскриптов во многих тысячах образцов путем объединения мультиплексных лопосредованная иммунизацией амплификация [5–7] с помощью Luminex FlexMAP (Luminex, Остин, Техас, США) с оптической адресацией и штрих-кодом ммикросфера и жнизкая цитометрическая система обнаружения, которую мы вместе называем LMF (Рисунок 1) [8]. Здесь мы подробно рассказываем о методе LMF и сообщаем о его общей эффективности.

Обзор метода. Транскрипты фиксируются на иммобилизованном поли-dT и подвергаются обратной транскрипции. Для каждого интересующего транскрипта конструируют два олигонуклеотидных зонда. Зонды, расположенные выше по течению, содержат 20 нуклеотидов, комплементарных сайту универсального праймера (Т7), одну из 100 различных последовательностей штрих-кода из 24 нуклеотидов и последовательность из 20 нуклеотидов, комплементарную 3'-концу соответствующей кДНК первой цепи. Зонды, расположенные ниже по течению, являются 5'-фосфорилированными и содержат последовательность из 20 нуклеотидов, примыкающую к ген-специфичному фрагменту зонда выше по течению, и сайт универсального праймера из 20 нуклеотидов (Т3). Зонды отжигаются к их мишеням, свободные зонды удаляются, а зонды соединяются рядом под действием лигазы с получением синтетических матриц амплификации 104 нт. ПЦР проводят с Т3 и 5'-биотинилированными праймерами Т7. Биотинилированные ампликоны со штрих-кодом гибридизируют с пулом из 100 наборов микросфер с оптической адресацией, каждая из которых экспрессирует зонды захвата, комплементарные одному из штрих-кодов, и инкубируют со стрептавидин-фикоэритрином для флуоресцентной метки фрагментов биотина. Захваченные меченые ампликоны количественно оцениваются, и гранулы декодируются с помощью проточной цитометрии. нуклеотиды nt.


Эффект тестирования

Эффект тестирования касается парадокса в жизни каждого студента медицинского вуза. Изучая фармакологию и пять основных побочных эффектов бета-адреноблокаторов, студенты читают факты, они обобщают их, повторно исследуют или запоминают их в течение значительного количества времени, а затем один раз проверяются на письменном или устном экзамене. В сознании среднего ученика тестирование - это средство оценки знаний, а не часть обучения.

Тестирование как активный элемент обучения более эффективно, чем повторное изучение фактических знаний [7]. Для изучения этого эффекта тестирования было проведено значительное количество экспериментов. Одним из примеров, приведенных в вышеупомянутой статье, является исследование Хогана и Кинча 1971 года [8]. Одна группа студентов изучала список из 40 слов четыре раза с небольшими перерывами между занятиями. Вторая группа студентов изучила список только один раз, а затем прошла три бесплатных теста на вспоминание. Двумя днями позже обе группы прошли заключительное испытание. Первая группа, изучившая список четыре раза, вспомнила около 15 процентов слов. Вторая группа, которая изучила один раз, а затем прошла три бесплатных теста на запоминание, запомнила около 20 процентов слов. Изучение списка слов только один раз, а затем проверка себя путем свободного запоминания привело к значительно лучшим результатам, чем четырехкратное изучение идентичного содержания.

Рандомизированное контролируемое исследование подтвердило эти результаты и обнаружило, что повторное тестирование привело к значительно более высокому долгосрочному удержанию, чем повторное изучение [9]. Это исследование включало дидактическую конференцию для врачей-педиатров и врачей неотложной помощи. Были две уравновешенные группы. Одна группа прошла тесты на тему эпилептического статуса и изучала обзорный лист по миастении. Вторая группа изучала обзорный лист по эпилептическому статусу и сдавала тесты на миастению. Сеансы тестирования и обучения проводились сразу после обучения и через два дополнительных временных интервала продолжительностью около 2 недель. Каждый раз участникам давалась обратная связь. Заключительный тест через 6 месяцев завершил исследование. Через шесть месяцев после начальной учебной сессии повторное тестирование привело к получению итоговых тестовых баллов, которые были в среднем на 13% выше, чем в группе повторного обучения [9].

Значительный вклад в эффект тестирования вносит первоначальная обратная связь, чтобы научить учащегося, был ли ответ правильным или неправильным. Интересно, что обратная связь способствует обучению, но даже тестирование без обратной связи полезно [10]. Исследование Roediger et al. представляет эксперимент, в котором четыре группы студентов читают отрывок из текста. Одна группа осталась пассивной после чтения, а три группы прошли тест с множественным выбором. Из этих трех групп одна была протестирована без обратной связи, другая получила немедленную обратную связь после каждого вопроса, а третья получила отложенную обратную связь по всем вопросам после всего теста. Через неделю после начального сеанса чтения все четыре группы прошли заключительный тест. Группа, не сдававшая тест, дала 11% правильных ответов. Те участники, которые были протестированы без обратной связи, представили 33 процента правильных ответов, немедленная обратная связь дала 43 процента, а отсроченная обратная связь - 54 процента правильных ответов. Таким образом, тестирование даже без обратной связи утроило результат теста через 1 неделю после первоначального изучения. Наилучшие результаты были получены с помощью отложенной обратной связи, которая намекает на положительный вклад пространственного представления учебного контента, который будет обсуждаться в одном из следующих разделов.

Несмотря на различные исследования, которые показали, что повторное тестирование более эффективно, чем повторное изучение, студенты, похоже, в значительной степени не осознают превосходство тестирования в поддержке краткосрочного удержания [11]. Когда учащиеся используют тестирование в контексте обучения, они применяют его для оценки знаний и не рассматривают его как методику интенсификации обучения. В частности, студенты, похоже, не осознают преимущества тестирования по сравнению с обучением.


Отказ от ответственности

Этот онлайн-тест остроты зрения не является медицинским обследованием и не заменяет визит к офтальмологу. Он не предназначен для использования в качестве диагностики заболеваний или других состояний, для лечения или для смягчения или предотвращения болезни. Этот тест просто направлен на то, чтобы дать вам общее представление о ваших зрительных способностях. Мы рекомендуем вам после этого теста провести полную оценку зрения у специалиста по зрению. Только офтальмологи могут принимать решения о лечении, диагнозе или назначении.


Часто задаваемые вопросы о t-тестах

T-тест - это статистический тест, который сравнивает средние значения двух выборок. Он используется при проверке гипотез с нулевой гипотезой о том, что разница в групповых средних равняется нулю, и с альтернативной гипотезой о том, что разница в групповых средних отлична от нуля.

T-критерий измеряет разницу средних групповых значений, деленную на объединенную стандартную ошибку двух групповых средних.

Таким образом, он вычисляет число (t-значение), показывающее величину разницы между двумя сравниваемыми групповыми средними, и оценивает вероятность того, что эта разница существует чисто случайно (p-значение).

Ваш выбор t-критерия зависит от того, изучаете ли вы одну группу или две, и заботитесь ли вы о направлении разницы в средних значениях группы.

Если вы изучаете одну группу, используйте парный t-тест для сравнения среднего значения группы с течением времени или после вмешательства, или использовать однократный t-критерий для сравнения среднего значения группы со стандартным значением. Если вы изучаете две группы, используйте двухвыборочный t-критерий.

Если вы хотите знать только, существует ли разница, используйте двусторонний тест. Если вы хотите знать, больше ли среднее значение одной группы, чем другое, используйте левостороннее или правостороннее односторонний тест.

А однократный t-критерий используется для сравнения одного населения со стандартным значением (например, чтобы определить, отличается ли средняя продолжительность жизни в конкретном городе от средней по стране).

А парный t-тест используется для сравнения одной популяции до и после некоторого экспериментального вмешательства или в два разных момента времени (например, для измерения успеваемости учащихся на тесте до и после изучения материала).

T-критерий не следует использовать для измерения различий между более чем двумя группами, потому что структура ошибок для t-критерия будет недооценивать фактическую ошибку, когда сравнивается много групп.

Если вы хотите сравнить средние значения сразу нескольких групп, лучше всего использовать другой статистический тест, такой как ANOVA или апостериорный тест.